Es en el año 1994 cuando la recién creada Federación se lanza a organizar el I congreso ANEO. Este evento marcó un hito histórico ya que, por vez primera, un grupo de estudiantes resulta capaz de organizar un importante Congreso de ámbito nacional. Resultó ser todo un éxito y el inicio de un acontecimiento único dentro del panorama universitario español.

El número de participantes en cada uno de los congresos ha ido creciendo gradualmente, y a lo largo de su historia se han llegado a concentrar hasta 400, lo que supone un elevado porcentaje del total de estudiantes de Odontología de las universidades españolas.

Hasta la fecha se han organizado veinticuatro congresos anuales, destacando el del año 2016 en Barcelona por organizarse junto con EDSA Meeting y en del 2017 en Madrid con  IADS Meeting, en este caso produciéndose en IFEMA junto a la FDI Madrid 2017.

Ediciones del congreso ANEO

I Congreso ANEO: Valencia ‘94

II Congreso ANEO: Santiago de Compostela ‘95

III Congreso ANEO: San Juan, Alicante ‘96

IV Congreso ANEO: Granada ‘97

V Congreso ANEO: Barcelona ‘98

VI Congreso ANEO: Madrid ‘99

VII Congreso ANEO: Bilbao ‘00

VIII Congreso ANEO: Valencia ‘01

IX Congreso ANEO: Santiago de Compostela ‘02

X Congreso ANEO: Sevilla ‘03

XI Congreso ANEO: Murcia ‘04

XII Congreso ANEO: Barcelona ‘05

XIII Congreso ANEO: Madrid ‘06

XIV Congreso ANEO: Santiago de Compostela ‘07

XV Congreso ANEO: Valencia ‘08

XVI Congreso ANEO: Bilbao ‘09

XVII Congreso ANEO: Zaragoza ‘10

XVIII Congreso ANEO: Granada ‘11

XIX Congreso ANEO: Santiago de Compostela ‘12 

XX Congreso ANEO: Valencia ‘13

XXI Congreso ANEO: Madrid ‘14

XXII Congreso ANEO: Zaragoza ‘15

XXIII Congreso ANEO & 58th EDSA Meeting: Barcelona ‘16

XXIV Congreso ANEO & 64th IADS Meeting: Madrid ‘17